NGSなどの大量のデータを扱っていると、ネットワーク経由でデータを転送する機会が多くあります。 また、NGS解析を小規模でやる分にはローカルマシンで作業しても問題はありませんが、大量に高速で計算させたい場合には、研究所や大学内のサーバー ...

前回は、ニワトリのゲノムをバックボーンとして取得し、染色体リネームを行いました。今回は、RNA-seqシミュレーションについて、その理論的背景と面白さを紹介します。 RNA-seq解析を学ぶには、実際のデータが必要です。しかし、実験データを取得するの ...

ゲノム医療の発展に貢献するRNA解析キットを販売 当社は、理化学研究所（埼玉県和光市 理事長:松本 紘、以下「理研」）生命機能科学研究センターバイオインフォマティクス研究開発チームが開発した「1細胞完全長トータルRNAシーケンス法『RamDA-seq(TM ...

生命科学の研究方法として、「シングルセル（単一細胞）解析」が大きな注目を浴びている。臓器に含まれる細胞を個別に解析していく研究方法であり、細胞集団を解析して平均値を捉えるこれまでの手法では見逃されてきた新しい細胞種、また、これまで ...

東京大学大学院農学生命科学研究科の藤原徹教授、中央大学理工学部の西田翔助教、横浜市立大学木原生物学研究所の筧雄介助教、嶋田幸久助教らの研究グループは、次世代シーケンサーを用いたRNA-Seq解析と情報学的解析により、モデル植物であるシロ ...

理化学研究所生命機能科学研究センターバイオインフォマティクス研究開発チームの林哲太郎技師、二階堂愛チームリーダーらの研究チーム※が開発した「1細胞完全長トータルRNA[1] シーケンス法『RamDA-seqTM 』 [2] 」がこのたび商用化につながりました。

多様な細胞から構成される胃、1細胞単位での遺伝子発現プロファイル解明が重要 東京大学は10月13日、ヒトの胃の13万7,610細胞のシングルセルRNA-seqおよび24万4,445細胞の空間遺伝子発現解析を行い、胃を構成する細胞の空間情報を含めた遺伝子発現 ...

〜シングルセルRNA-seq解析および空間トランスクリプトーム解析技術を統合した最先端の手法により解明〜 東京慈恵会医科大学総合医科学研究センター次世代創薬研究部の藤田雄准教授、同大学内科学講座呼吸器内科の渡邉直昭助教、平野悠太助教、吉田 ...

〜シングルセルRNA-seq解析および空間トランスクリプトーム解析技術を統合した最先端の手法により解明〜 東京慈恵会医科大学総合医科学研究センター次世代創薬研究部の藤田雄准教授、同大学内科学講座呼吸器内科の渡邉直昭助教、平野悠太助教、吉田 ...

新しい1細胞解析法scRepli-RamDA-seq（scRR-seq）を開発。この手法により、個々の細胞においてゲノムDNAと遺伝子発現を同時に解析できるようになった。 scRR-seqは、DNAとRNAの双方について、高品質かつ高解像度の解析を実現。 scRR-seqを用いることで、単一細胞内に ...