今回は（いつもですが）データ処理ではなく、ワークフローについてChatGPT3.5さんから得た情報をメモしておきます。 回答の信憑性については裏取りをしていないため、関連する公式ページや書籍、原著論文などで再確認する必要があります。 雰囲気を掴む ...

pythonのパッケージインストーラーのmambaを利用する 環境構築に関しては、各OSで異なる場合があるので一つずつ行うのが良い。 pipeline.shには、全てのファイルを一括で送信するためのコードを記載してあるが、ライブラリの個々のパラメータについて備忘録 ...

前回は、ニワトリのゲノムをバックボーンとして取得し、染色体リネームを行いました。今回は、RNA-seqシミュレーションについて、その理論的背景と面白さを紹介します。 RNA-seq解析を学ぶには、実際のデータが必要です。しかし、実験データを取得するの ...

生命科学の研究方法として、「シングルセル（単一細胞）解析」が大きな注目を浴びている。臓器に含まれる細胞を個別に解析していく研究方法であり、細胞集団を解析して平均値を捉えるこれまでの手法では見逃されてきた新しい細胞種、また、これまで ...